تطمح كلية التقنية الحيوية إلى تحقيق أهداف رسالتها العلمية في مجالات التعليم والبحث وخدمة المجتمع والمشاركة الفعالة في مختلف مجالات تطبيقات التقنية الحيوية، ومواكبة تطور علوم التقنية الحيوية في العالم ومدى الاستفادة منها منهم. بما في ذلك في المجالات البحثية والعلمية والصناعية في وطننا الحبيب، وتحقيق الأهداف الرئيسية التي تطمح إليها الكلية.
ويهدف إلى التعامل مع النباتات المختلفة واستخلاص وإنتاج مكونات الخلايا النباتية (من المركبات الأيضية الثانوية) مثل المركبات الدوائية والمبيدات والأصباغ والمركبات المستخدمة في الصناعات الغذائية وغيرها، وتطوير نباتات معدلة وراثيا لمقاومة الأمراض، وتتحمل الملوحة، وغيرها من خلال التقنيات الزراعية مثل الهندسة النسيجية والوراثية.